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如何查找一个基因参与的代谢通路

发布时间:2019-08-13 18:30 来源:未知 编辑:admin

  一般现在的科技服务公司如果做了kegg pathway数据库注释的话,都会做代谢通路图的注释,可以从结果文件中的代谢通路图查找,找到想要的代谢通路图后,再分析哪些基因在基因组上存在。

  谢通路是kegg数据库里的pathway数据库。可以通过全基因组预测了编码基因后,进行pathway数据库注释,从注释结果的功能信息中通过关键字查找。一般都能找到。如果找不到,有可能是关键字不对或者基因组中没有这样的代谢通路功能基因。

  代谢通路:目前在通路数据库(PATHWAYdatabase)中代谢通路是建立得最好的,有大约90个参考代谢途径的图形。每个参考代谢途径是一个由酶或EC号组成的网络。

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